Tokyo sokaklarında yaşamakta olan üç evsiz (evden kaçan lise öğrencisi Miyuki, transseksüel Hana ve orta yaşlı alkolik Gin) bir Noel Arifesi’nde çöplerin içinde bir bebek bulurlar. Hep anne olma hayali kurmuş olan Hana, bebeği o gecelik yanlarında tutmak için diğer ikisini ikna eder. Sonraki gün bebeğin annesini bulmak için Tokyo’nun köhne sokaklarından ışıklı caddelerle dolu zengin semtlerine doğru yola çıkarlar. Bu yolculuksa hayatlarının macerası olur; çünkü üçlü kendi geçmişleriyle de yüzleşmek zorunda kalacaklardır. Perfect Blue’nun yaratıcısı Satoshi Kon’un diğer filmlerine göre daha kolay izlenebilir bir hikaye sunduğu Tokyo Godfathers, hem komik hem hüzünlü hikayesiyle yönetmenin en başarılı çalışmalarından biri.