1976 yılında Ardahan'da dünyaya geldi. İlk ve orta öğrenimini Ardahan'da, lise eğitimini Bursa'da tamamladı. 1998 yılında Kafkas Ünv. Veteriner Fakültesini tamamlayarak Ardahan merkezde serbest veteriner hekim olarak çalışmaya başladı. 17 yıldır bu hizmete devam etmektedir.
AK Parti'de 5 yıl il genel meclis üyeliği yapan Yunus Baydar 2010-2015 yılları arasında 5 yıl il başkanlığını yürüttü. Ayrıca 2008 yılından itibaren de Ardahan damızlık sığır yetişticileri birliği başkanlığını yürüten Baydar, evli ve 3 çocuk babasıdır.