İshak Gündoğan, Eskişehir Mahmudiye İlçesi Türkmenmecidiye köyünde 1961 yılında dünyaya geldi. İlkokulu Türkmenmecidiye ilkokulunda bitirdi.
Tarımla uğraşan Gündoğan, 1994 – 1999 yılları arasında Türkmenmecidiye köyünde Köy Muhtarlığı 1. Azası olarak ve kısa dönem muhtarlık yaptı.
1996 – 1997 yıllarında Türkmenmecidiye köyü sulama kooperatifinde başkan yardımcılığı görevinde bulundu.
22.02.1997 tarihinde Mahmudiye Ziraat Odası meclis başkanlığı görevine seçildi.
26.02.2001 tarihinde Mahmudiye Ziraat Odası meclis başkanlığı görevine seçildi.
Başkanlık görevini 17.02.2011 tarihine kadar yürüttü halen ziraat odası meclis kurulu üyeliğini devam ettirmektedir.
2004 yerel seçimlerinde Mahmudiye İlçesinden CHP İl Genel Meclis Üyesi seçildi.
2009 yerel seçimlerinde tekrar Mahmudiye İlçesinden CHP İl Genel Meclis Üyesi seçildi ve İl Genel Meclisindeki CHP Grup Başkan Vekilliği görevlerini yürüttü. 2013 yılında CHP yerel yönetici eğitimine katıldı.
30 Mart 2014 Mahalli İdareler Seçimlerinde Mahmudiye İlçesi Belediye Başkanlığını kazandı.
İshak Gündoğan, 31 Mart 2019’da yapılacak olan yerel seçimlerde yeniden CHP’nin Eskişehir Mahmudiye ilçesi Belediye Başkan adayı oldu.
Evli ve 4 çocuk babasıdır.
