1956 yılında Ankara’nın Güdül İlçesinde doğdu. İlk, orta ve lise eğitimini Ankara’da tamamladı.1980-1994 yılları arasında Çağa Belediyesi Hesap İşleri Müdürlüğü görevini yürüttü.
Muzaffer Yalçın, 1994-2004 yılları arasında iki dönem Çağa Belediye Başkanlığı görevinde bulundu. 2004-2009 yıllarında AK Parti Güdül İlçe Yönetimi’nde ilçe sekreterliği yaptı ve diğer teşkilat görevlerinde de bulundu. 2009-2014 yıllarında AK Parti’den Çağa Belediye Başkanlığını üstlendi.
30 Mart 2014 seçimlerinde Güdül Belediye Meclis Üyesi seçildi.
Muzaffer Yalçın, evli ve üç çocuk sahibidir.
31 Mart 2019 Yerel Seçimlerinde AK Parti’den Ankara İli, Güdül İlçesi Belediye Başkan adayı oldu
